น้ำเต้าต้นจัดเป็นไม้พุ่มหรือยืนต้นขนาดกลางไม่ผลัดใบต้นสูงประมาณ 2 - 10 เมตร แตกกิ่งก้านแผ่ตามแนวราบ รูปทรงพุ่มไม่ค่อยแน่นอน แต่ส่วนมากจะมีขนาดทรงพุ่ม 6 - 10 เมตร ส่วนเรือนยอดโปร่งทรงกลม ใบเป็นใบเดี่ยวออกแบบเรียงสลับ ใบมีลักษณะรูปช้อนโคนใบสอบแหลมปลายใบมน หรือ อาจมีติ่งแหลมเล็กน้อย สีเขียวสด ใบมีขนาดกว้าง 3.5 เซนติเมตร ยาว 10 เซนติเมตร ไม่มีก้านใบแต่มีใบประดับขนาดเล็กรูปร่างคล้ายใบออกที่โคนใบจำนวน 2 ใบ อยู่ตามข้อของกิ่ง ดอกเป็นดอกเดี่ยวออกบริเวณลำต้นและกิ่ง ลักษณะของดอกจะห้อยหัวลงดอกเป็นรูปปากแตรมีกลิ่นเหม็นหืนเป็นสีเขียวอมเหลืองและมีลายริ้วสีม่วง โคนดอกเชื่อมติดกันเป็นหลอดยาว 5 - 7 เซนติเมตร ปลายดอกแยกออกเป็นกลีบ 5 กลีบ ดอกมีขนาดยาว 2 - 3 นิ้ว มีขนาดเส้นผ่าศูนย์กลางดอก 3 - 5 เซนติเมตร และมีเกสรตัวผู้อยู่ 4 ก้าน ผล เป็นผลสดทรงกลมขนาดใหญ่โดยมี ขนาด 15 - 50 เซนติเมตร ผิวผลแข็งเรียบ เกลี้ยง ผลมีสีเขียวสด เมื่อสุกจะเปลี่ยนเป็นสีเหลืองอมเขียว ภายในผลมีเนื้อและเมล็ดแบนๆ สีน้ำตาลเข้าจำนวนมาก
